Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med13Q5SWW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Med13Q5SWW4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms