Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tsr1Q5SWD9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tsr1Q5SWD9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms