Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssh2Q5SW75 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssh2Q5SW75 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh2Q5SW75 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssh2Q5SW75 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms