Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc42Q5SV66 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc42Q5SV66 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms