Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bbs12Q5SUD9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bbs12Q5SUD9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms