Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Psme4Q5SSW2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psme4Q5SSW2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psme4Q5SSW2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms