Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Utp18Q5SSI6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Utp18Q5SSI6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms