Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyb5d2Q5SSH8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms