Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rnf215Q5SPX3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rnf215Q5SPX3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms