Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bhlha9Q5RJB0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms