Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Trappc1Q5NCF2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
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