Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Trim41Q5NCC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Trim41Q5NCC3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms