Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC83

Spata48, Spermatogenesis-associated protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata48Q5NC83 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Spata48Q5NC83 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Spata48Q5NC83 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms