Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1810065E05RikQ5NC41 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1810065E05RikQ5NC41 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms