Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf3Q5HZG4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Taf3Q5HZG4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Taf3Q5HZG4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms