Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SynaQ5G5D5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SynaQ5G5D5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms