Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1lQ5D525 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Syce1lQ5D525 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms