Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CenpjQ569L8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CenpjQ569L8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms