Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rtl6Q505G4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rtl6Q505G4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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