Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd28Q505D1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd28Q505D1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms