Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc84Q4VA36 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc84Q4VA36 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms