Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Xirp2Q4U4S6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Xirp2Q4U4S6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms