Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

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Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Herc2Q4U2R1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Herc2Q4U2R1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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