Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp235Q499D5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp235Q499D5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms