Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krt35Q497I4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt35Q497I4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms