Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0W9

4930432M17Rik, RIKEN cDNA 4930432M17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930432M17RikQ3V0W9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
4930432M17RikQ3V0W9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms