Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ankrd53Q3V0J4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms