Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc27Q3V036 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc27Q3V036 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms