Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc160Q3UYG1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms