Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E330034G19RikQ3UWX6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E330034G19RikQ3UWX6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms