Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim40Q3UWA4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms