Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pate2Q3UW31 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pate2Q3UW31 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms