Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slfn4Q3UV66 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Slfn4Q3UV66 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms