Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Chpf2Q3UU43 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Chpf2Q3UU43 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms