Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thsd4Q3UTY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms