Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fchsd2Q3USJ8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd2Q3USJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms