Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm28047Q3US59 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm28047Q3US59 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms