Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain3Q3URJ8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkain3Q3URJ8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain3Q3URJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain3Q3URJ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain3Q3URJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain3Q3URJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain3Q3URJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms