Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Shisa3Q3UPR0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Shisa3Q3UPR0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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