Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap2Q3UND0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Skap2Q3UND0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms