Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Hdgfl2Q3UMU9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms