Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cobll1Q3UMF0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cobll1Q3UMF0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms