Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc33Q3ULW6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms