Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Mccc2Q3ULD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mccc2Q3ULD5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms