Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E330014E10RikQ3UL33 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E330014E10RikQ3UL33 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms