Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Ell2Q3UKU1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ell2Q3UKU1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms