Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp19Q3UJD6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp19Q3UJD6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms