Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Edc4Q3UJB9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Edc4Q3UJB9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms