Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms