Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms